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Nachdem er von 2000 bis 2015 als Professor für Bodenkunde an der Hochschule für Weinbau und Önologie (HES – Changins) verantwortlich war und Präsident der Schweizerischen Gesellschaft für Pedologie war, ist Professor Stéphane Burgos seit 2015 Professor an der Fachhochschule . Bernoise - Universität für Agrar-, Forst- und Lebensmittelwissenschaften (BFH – HAFL). Innerhalb dieser Einrichtung ist er für die Pedologiegruppe „Bodennutzung und -schutz“ im Fachbereich Agronomie verantwortlich. Die Forschungs- und Lehrgebiete seiner Gruppe umfassen vor allem Geologie, Pedologie, Bodenkartographie und -schutz sowie Pflanzenernährung (Feldfrüchte).
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